祁連縣位于青海省東北部，海北藏族自治州西北部，東與門源、大通縣接壤，南與海晏、剛察縣相連，西與天峻縣為鄰，北及西北與甘肅省酒泉、肅南、民樂、山丹為界。“祁連”是古匈奴語，意為“天山”，是青海北部的天然屏障，古為羌地，是通西域之要道，絲綢之路南線經于此，北出扁都口與甘肅省接壤，古有“青海北大門”之稱。